Fiscalidad en eCommerce vs. Comercio Tradicional: Claves Contables y Tributarias

El auge del comercio electrónico ha cambiado la forma de comprar y vender, pero también ha traído consigo particularidades contables y fiscales que lo diferencian del comercio tradicional. Entender la fiscalidad en el eCommerce y su diferenciación con el comercio tradicional es clave para mantener una buena salud financiera y cumplir con las obligaciones tributarias.

A lo largo de este artículo, exploramos las diferencias clave entre el eCommerce y el comercio tradicional, y al final, encontrarás una checklist práctica que te ayudará a evaluar la salud fiscal y contable de tu negocio online.

A continuación, analizamos los principales puntos diferenciadores con ejemplos, explicaciones claras y una tabla comparativa.

1. Reconocimiento de ingresos

beneficios de aplicar una buena fiscalidad en el eCommerce

eCommerce

El ingreso no siempre se puede reconocer en el momento de la venta. Hay que tener en cuenta:

  • El momento del pago (que puede ser inmediato o diferido)
  • El envío del producto
  • La aceptación definitiva por parte del cliente (p. ej., tras el periodo de devolución de 14 días en la UE)
Ejemplo: Si una tienda online vende un producto el 1 de marzo, pero el cliente lo devuelve el 10. En este caso, se debe anular el ingreso contable y devolver el IVA repercutido para evitar discrepancias fiscales.

Comercio tradicional

La venta y el cobro suelen coincidir en el tiempo (en tienda física), lo que simplifica el reconocimiento de ingresos.

2. Medios de cobro

eCommerce

Utiliza plataformas como PayPal, Stripe o Klarna que:

  • Aplican comisiones que deben registrarse correctamente
  • Pueden retener los pagos varios días
  • Exigen una conciliación periódica con el banco
Ejemplo: Si una empresa vende un producto por 100€ a través de Stripe, solo recibe 97,50€ en su cuenta bancaria. Los 2,50€ corresponden a la comisión de la plataforma y deben registrarse como gasto financiero.

Comercio tradicional

El cobro es inmediato (efectivo o TPV) y la conciliación bancaria es más sencilla.

3. Almacenes y logística

almacenes y logística

eCommerce

Puede trabajar con:

  • Almacenes propios
  • Dropshipping (sin stock propio)
  • Fulfillment (como Amazon FBA)

Cada modelo implica una gestión contable distinta del inventario y costes logísticos.

Ejemplo: Si un eCommerce de accesorios de cocina decide cambiar su modelo de almacenamiento a un sistema de fulfillment con Amazon FBA. Si bien esto reducidiría los costes de envío y almacenamiento, también les obligaría a gestionar la facturación de manera distinta debido a los reportes generados por Amazon.

Comercio tradicional

El stock está centralizado y la trazabilidad es directa.

4. Devoluciones

eCommerce

Las devoluciones son más frecuentes y requieren:

  • Emisión de abonos.
  • Registro de reembolsos.
  • Ajuste de ingresos y existencias.
Ejemplo: Si un eCommerce de moda infantil tiene una alta tasa de devoluciones, debe restar los ingresos correspondientes y ajustar el IVA repercutido cada vez que se devuelven productos, lo que requiere un seguimiento constante. A diferencia del comercio tradicional, donde las devoluciones suelen gestionarse directamente en tienda y de forma más sencilla.

Comercio tradicional

Menos devoluciones, gestión directa en tienda.

5. IVA en ventas intracomunitarias

como afectan los pagos en la fiscalidad en el eCommerce

eCommerce (B2C)

Desde julio de 2021, se aplica el sistema OSS (One Stop Shop):

  • Se aplica el tipo de IVA del país del comprador.
  • Se presenta una declaración única trimestral.

Ejemplo: Si una eCommerce de productos de belleza en España empezase a vender en Alemania y Francia. En lugar de registrarse en cada país, podría optar por el OSS, lo que simplicaría sus obligaciones fiscales y agilizaría sus declaraciones de IVA.

Para una comprensión más profunda sobre el régimen de la Unión y su aplicabilidad, puedes leer nuestro artículo sobre qué es y a quién va dirigido el UOSS.

Comercio tradicional

Generalmente no aplica OSS. El IVA suele ser local

6. Lugar de tributación

eCommerce

Puede generar obligaciones fiscales en otros países si:

  • Supera umbrales de venta.
  • Usa almacenes extranjeros.
Ejemplo: Un negocio que almacena productos en un almacén de Amazon en Alemania podría verse obligado a registrarse y pagar IVA en dicho país, mientras que una tienda física solo tributa en su país de origen.

Comercio tradicional

Menor exposición a estos escenarios.

7. Operaciones con terceros países (fuera de la UE)

eCommerce

  • Exportaciones: exentas de IVA pero documentadas con DUA.
  • Importaciones: conllevan IVA de importación, aranceles y control aduanero.

Si estás considerando importar productos para vender en plataformas como Amazon, te recomendamos leer nuestro artículo sobre cómo comprar en Alibaba y vender en Amazon, donde se detallan las obligaciones fiscales de la importación.

Ejemplo: Si un eCommerce español importa productos de China, debe pagar IVA en la aduana antes de venderlos en España. Una tienda física, en cambio, generalmente trabaja con proveedores locales y evita este tipo de trámites.
  • Si realizas importaciones o exportaciones, asegúrate de cumplir con la normativa aduanera. Puedes consultar la guía de la Agencia Tributaria aquí.

Comercio tradicional

Tributación nacional. Sin necesidad de registros internacionales.

8. Facturación y tickets simplificados

en qué afectan las facturas a la fiscalidad en el eCommerce

eCommerce

  • No siempre se emite factura automática.
  • Obligado a conservar registros digitales accesibles.
  • Puede emitir justificantes simplificados.
Ejemplo: Un eCommerce de productos electrónicos que vende accesorios de bajo coste puede optar por emitir tickets simplificados en lugar de facturas completas, siempre que la normativa lo permita.

Comercio tradicional

Se entrega ticket o factura en tienda según normativa.

9. Marketplaces

eCommerce

Si vendes en Amazon, Etsy, etc.:

  • El marketplace puede ser responsable del IVA en ciertos países.
  • Las comisiones deben registrarse contablemente.
  • Puede haber ventas simuladas al marketplace.

Para entender mejor tus obligaciones fiscales como vendedor en Amazon FBA, consulta nuestro artículo sobre Amazon FBA desde una perspectiva fiscal.

Ejemplo: Un vendedor que usa Amazon FBA en Alemania debe considerar que Amazon recauda y declara el IVA en su nombre en determinados casos, lo que implica ajustes contables para evitar declaraciones duplicadas.

Si vendes en Amazon, revisa sus normas sobre gestión del IVA en Europa en su portal oficial aquí.

Comercio tradicional

No opera en este modelo intermediarista.

Checklist práctica para eCommerce

Reconocimiento de ingresos: ¿Tienes en cuenta las devoluciones y el momento del pago en tu contabilidad?

Medios de cobro: ¿Registras correctamente las comisiones de las plataformas de pago y realizas conciliaciones bancarias frecuentes?

Almacenes y logística: ¿Tu modelo de almacenamiento está alineado con tu contabilidad y obligaciones fiscales?

Devoluciones: ¿Tienes un proceso claro para registrar abonos, reembolsos y ajustes de stock e ingresos?

IVA en ventas intracomunitarias: ¿Estás dado de alta en el OSS si vendes a otros países de la UE? Aprende más sobre el UOSS y su aplicabilidad.

Lugar de tributación: ¿Sabes en qué países necesitas registrarte para cumplir con el IVA y otros impuestos? Nuestro artículo sobre el NIF Intracomunitario te ofrece información detallada.

Operaciones internacionales: ¿Conoces las implicaciones fiscales de importar y exportar fuera de la UE?

Facturación y tickets: ¿Cumples con los requisitos de facturación digital y emisión de justificantes simplificados?

Marketplaces: ¿Estás contabilizando correctamente las comisiones y obligaciones fiscales asociadas a las ventas en plataformas de terceros?

Tabla comparativa resumen

Concepto Comercio Electrónico Comercio Tradicional
Reconocimiento de ingresos Desfase por envío y devoluciones Inmediato al realizar la venta
Medios de cobro Pasarelas de pago con comisiones Efectivo o TPV
Almacenes y logística Dropshipping, fulfillment, almacenes Almacén local o en tienda
Devoluciones Frecuentes, requieren ajustes contables Menos frecuentes, fácil gestión en tienda
IVA intracomunitario Requiere OSS y aplica IVA del comprador Aplica IVA local
Lugar de tributación Puede requerir registro en otros países Solo tributación nacional
Operaciones internacionales Importaciones/exportaciones habituales Poco frecuentes

Conclusión

Conocer bien la fiscalidad en el eCommerce ofrece grandes oportunidades de crecimiento, pero también exige una gestión contable y fiscal más técnica.
Un asesor especializado puede ayudarte a optimizar tu carga fiscal y evitar problemas legales.
Consulta con nuestros expertos y asegura el cumplimiento tributario de tu negocio digital.

Si has llegado hasta aquí, no te quedes con ninguna duda en el tintero. Aprovecha nuestra sesión de consulta gratuita para seguir avanzando. Pide fecha ya mismo.